Reduce el efecto de las contaminaciones

Diseñan un protocolo para mejorar la detección de virus en muestras de sangre de personas sanas

Esta investigación del Instituto de Biología Integrativa de Sistemas (I2SysBio), centro mixto de la UV y el CSIC, también ha descrito 28 especies potencialmente nuevas de anellovirus

Investigadores del Instituto de Biología Integrativa de Sistemas (I2SysBio), centro mixto de la UV y el CSIC (Foto: UV)
Investigadores del Instituto de Biología Integrativa de Sistemas (I2SysBio), centro mixto de la UV y el CSIC (Foto: UV)

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03.08.2021 - 16:00

El Instituto de Biología Integrativa de Sistemas (I2SysBio), centro mixto de la UV y el CSIC, ha elaborado un procedimiento que incrementa la sensibilidad para detectar virus en muestras sanguíneas de personas sanas, además de reducir el efecto de las contaminaciones.

Esta investigación, publicada en Scientific Reports, también ha descrito 28 especies potencialmente nuevas de "anellovirus", una familia presente en numerosas especies animales para la que no se han detectado de momento claras asociaciones con patologías concretas.

La detección de virus en muestras de sangre ha sido facilitada por las nuevas técnicas de análisis metagenómico, pero todavía existen barreras a superar antes de poder establecer mecanismos rutinarios de vigilancia.

Para ello, el I2SysBio ha diseñado un protocolo dirigido a enriquecer la fracción de virus en muestras de personas sanas y así aumentar la probabilidad de detectar nuevos virus o, simplemente, rescatar una mayor diversidad de los ya conocidos.

"Cuando se secuencia una muestra biológica, fundamentalmente se encuentran los ácidos nucleicos del hospedador (en este caso, humano), o cualquier tipo de organismo que contamina la muestra con la que se trabaja, así que para evitar esto hemos definido este protocolo específico de purificación", relata José Manuel Cuevas, principal responsable del estudio y miembro del I2SysBio.

La investigación ha descrito 28 especies potencialmente nuevas de "anellovirus"

El procedimiento, en el que también colaboró el Centro de Transfusión de la Comunitad Valenciana, ha consistido en someter muestras de plasma agrupadas de 120 donantes sanos a centrifugación de alta velocidad. Posteriormente, las partículas virales concentradas en un volumen menor se han purificado mediante procedimientos moleculares, tras lo que se ha llevado a cabo la secuenciación masiva de las muestras.

Este tipo de estudio basado en la secuenciación masiva es relativamente nuevo. En él se recuperan miles de millones de secuencias de una muestra biológica en cuestión y se puede hallar una gran variedad taxonómica de todo lo que hay en la muestra, resalta el investigador en un comunicado de la Universitad de Valencia.

Una vez descartada la contaminación a través de este procedimiento, los expertos han encontrado una amplia diversidad de "anellovirus", la familia viral que se encuentra con mayor frecuencia en la sangre humana y que es aparentemente inocua. Estos virus representaban casi el 97% del total de secuencias virales obtenidas en el estudio. Se han detectado 28 especies de "anellovirus" potencialmente nuevas, lo que supone un incremento notable en la diversidad descrita para estos virus en poblaciones humanas.

Más allá de buscar algún tipo de asociación patológica, la investigación recalca la gran diversidad de "anellovirus" encontrados, fundamentalmente gracias al protocolo implementado de enriquecimiento de la fracción viral. Los resultados apuntan así a la importancia de aplicar procedimientos de purificación más eficientes que enriquezcan la fracción viral como paso esencial en los estudios de viroma, además de cuestionar el carácter potencialmente patológico sugerido para los "anellovirus".

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