El Ministerio de Sanidad ha publicado una nueva actualización relativa a la situación de las variantes del SARS-CoV-2 en España. La variante Ómicron (B.1.1.529) continúa siendo la dominante en nuestro país. Esta comprende cinco linajes (BA.1, BA.2, BA.3, BA.4 y BA.5, así como los sublinajes derivados de estos.
El informe pone de manifiesto que se han detectado numerosos linajes derivados de BA.2, BA.4 y BA.5, así como recombinantes que presentan mutaciones que podrían guardar relación con una mayor capacidad de escape inmunitario en comparación con las variantes previamente circulantes. El hecho de que compartan una o varias mutaciones clave indica que, muy probablemente, son el resultado de la presión selectiva ejercida por los niveles actuales de inmunidad en la población.
Entre ellos destacan algunos con pocas diferencias pero que se han detectado en niveles significativos como son BA.4.6 o BF.7. Y otros, detectados en porcentajes mucho menores, pero con muchas más diferencias en su perfil de mutaciones respecto a los linajes dominantes que, in vitro, demuestran una capacidad mayor de evasión de la respuesta inmune. Entre estos destacan: BA.2.3.20, BA.2.75.2, CA.1, BR.2, BN.1, BM.1.1.1, BU.1, BQ.1, BQ.1.1, y XBB y linajes derivados de todos ellos.
El Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades (ECDC, por sus siglas en inglés) designaba en octubre de 2022 el linaje BQ.1 y sus sublinajes, incluyendo BQ.1.1, como variantes de interés. Actualmente estos linajes son los dominantes en España y en los países de nuestro entorno.
El linaje XBB.1.5 se encuentra en expansión en Estados Unidos donde habría superado el 25% de los casos en la primera semana de enero
El 8 de diciembre se designó también como variante de interés al linaje recombinante XBB. Por el momento no existen indicios de que ninguno de estos linajes se relacione con una mayor gravedad de los casos.
El linaje XBB.1.5 se encuentra en expansión en Estados Unidos donde habría superado el 25% de los casos en la primera semana de enero. Este linaje presenta una mutación en la posición 486 (F486P) que le confiere la capacidad de evasión de la respuesta a los anticuerpos que ya presentaban XBB o XBB.1, pero afecta en menor grado a la unión al receptor ACE2 (lo que podría implicar una mayor capacidad de transmisión respecto a XBB y XBB.1). En España se ha detectado hasta ahora de manera puntual.
Mediante la secuenciación de muestras aleatorias, en la semana 50 de 2022 (12 a 18 de diciembre) el porcentaje de Ómicron se sitúa en nuestro país en el 100%. Los linajes de Ómicron BQ.1 y derivados de este, incluyendo BQ.1.1, que dominan también en otros países europeos y presentan mutaciones clave en la espícula adicionales a las de BA.4/5, suponen el 82,6% de todas las muestras secuenciadas de manera aleatoria en la semana 50.
El linaje XBB.1.5, cuyo porcentaje ha registrado un aumento en las últimas semanas en Estados Unidos, se ha detectado de forma puntual hasta la fecha en España. El Servicio de Microbiología y Enfermedades Infecciosas del Hospital Gregorio Marañón ha detectado el primer caso secuenciado en la Comunidad de Madrid de XBB 1.5, siendo el quinto caso confirmado a nivel nacional.
En los análisis en aguas residuales, se encontró un predominio de BA.4/BA.5 a nivel nacional.