El Ministerio de Sanidad ha publicado una nueva actualización del informe sobre la situación epidemiológica de las variantes del SARS-CoV-2 en España. De acuerdo con este, la variante Ómicron (B.1.529, detectada originalmente en Sudáfrica) continúa siendo la dominante en nuestro país.
Comprende cinco linajes (BA.1, BA.2, BA.3, BA.4 y BA.5) y los sublinajes derivados de estos. BA.1 fue el linaje mayoritario durante la primera fase de expansión y, por tanto, las características (mayor capacidad de escape inmune que variantes previas, incremento en transmisibilidad y menor gravedad de los casos) para la variante se corresponden con las de este linaje. BA.2, que presenta numerosas diferencias respecto a BA.1, fue aumentando hasta convertirse en el linaje predominante a nivel global desde marzo hasta junio de 2022.
Posteriormente, los linajes BA.2.12.1, BA.4 y BA.5, que mostraban una ventaja de crecimiento sobre BA.2, fueron aumentando progresivamente su prevalencia a nivel global. Las mutaciones presentes en estos linajes suponen un importante cambio antigénico (particularmente frente a BA.1) lo cual les otorga un mayor escape inmune. Hasta el momento no se han observado diferencias en la gravedad de los casos para ninguno de ellos.
Con un mayor ritmo de crecimiento, BA.5 se impuso finalmente como linaje dominante desde el mes de julio hasta la actualidad. En España, este reemplazo de BA.2 por BA.5 se produjo a mediados del mes de junio coincidiendo con un aumento en la incidencia.
El porcentaje promedio de muestras secuenciadas de las que se dispone de información en SiViEs, sobre el total de casos detectados en España, ha sido del 1,6%, oscilando entre 1,2 y 2,2%
Mediante la secuenciación de muestras aleatorias, en la semana 34 de 2022 (del 22 al 28 de agosto) el porcentaje de Ómicron se sitúa en el 100%. Los linajes predominantes son BA.5 y sus derivados. Los cribados aleatorios mediante PCR específica para los linajes BA.4 y BA.5 han detectado en la semana 35 de 2022 (22 de agosto al 4 de septiembre) porcentajes que oscilan en las diferentes comunidades autónomas entre el 94,4 y el 100%. Esta misma semana, para el linaje BA.2, se encuentra entre el cero y el 4,8%.
En cuanto a la secuenciación, desde la semana 19 a la 34 de 2022 (9 de mayo al 28 de agosto) un promedio de 1.172 casos semanales cuenta con información derivada de la secuenciación (640 asociadas a muestreo aleatorio, 469 no asociadas a muestreo aleatorio y 63 en las que no consta esta información). En estas mismas semanas, el porcentaje promedio de muestras secuenciadas de las que se dispone de información en SiViEs, sobre el total de casos detectados en España, ha sido del 1,6%, oscilando entre 1,2 y 2,2%.
INFORMACIÓN DERIVADA DEL ANÁLISIS DE AGUAS RESIDUALES
En la semana del 28 de agosto al 3 de septiembre de 2022, la variante Ómicron se detecta en las 54 estaciones depuradoras de aguas residuales (EDAR) que participan en el proyecto VATar-COVID-19.
Los resultados de las RT-PCR dúplex son compatibles con un predominio de BA.3/BA.4/BA.5 (la técnica empleada no permite diferenciar entre estos sublinajes de Ómicron) en la práctica totalidad de las estaciones depuradores de aguas residuales (EDAR) analizadas a excepción de dos.